如何使用iTOL在进化树中添加热图

这篇文章主要介绍如何使用iTOL在进化树中添加热图，文中介绍的非常详细，具有一定的参考价值，感兴趣的小伙伴们一定要看完！使用的工具依然是iTOL这款在线软件，可点这里绘一棵超酷炫的系统发育树了解iTOL的使用方法。基础的使用方法就不再讲述了，只对配置文件进行说明。
首先来看一下所需要的文件的格式：格式说明：配置文件中以”#”开头的行是注释行，只起说明作用，iTOL不会读取该行的内容。免费云主机域名DATASET_HEATMAP：配置文件数据类型声明，这里声明数据集是对进化树添加热图信息。SEPARATOR SPACE：指定数据分隔符，即数据列与列之间使用空格分隔。COLOR #ff00ff：指定数据集初始颜色，可在后面进行更改。FIELD_LABELS A1 A2 A3 B1 B2 B3：为DATA中的每一列数据定义标签（指定样品名称）。MARGIN 0：指定热图与进化树之间的距离，可为负数，会导致与进化树重叠。STRIP_WIDTH 25：指定热图中每一格的宽度。COLOR_MIN #ff0000：指定热图中最小值的颜色。COLOR_MAX #0000ff：指定热图中最大值的颜色。USE_MID_COLOR 1：指定是否设置中间值颜色，0代表不设置，1代表设置。COLOR_MID #ffff00：指定热图中中间值的颜色。如果没有特殊设置，以上部分通常不需要改，直接拷贝使用即可。DATA之后的行就是所有的基因在各样品中的表达量数据，这里我用的数据是基因在样品中的表达量水平log2（FPKM）进行归一化转换（scale number）后的值。数据分为七列，第一列为进化树枝节点ID（基因ID），第二到第七列为基因在各样品中的表达量数据，注意数据要与FIELD_LABELS所指定样品名称的数量及顺序保持一致。按照以上格式准备好注释文件后，直接将其拖到iTOL进化树展示所在的位置，就能自动在进化树中添加热图了。如果对图片的效果不满意，还也可以在Datasets中对热图的颜色、宽度及位置进行调整。以上是“如何使用iTOL在进化树中添加热图”这篇文章的所有内容，感谢各位的阅读！希望分享的内容对大家有帮助，更多相关知识，欢迎关注百云主机行业资讯频道！

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