怎么使用R语言包RIdeogram展示blast双序列比对结果，针对这个问题，这 香港云主机篇文章详细介绍了相对应的分析和解答，希望可以帮助更多想解决这个问题的小伙伴找到更简单易行的方法。RIdeogram 是用来展示 染色体组型 （idiogram）的一个R语言包，比如展示snp的密度分布；展示某类基因在染色体上的分布等等。发表的论文是RIdeogram: drawing SVG graphics to visualize and map genome-wide data on the idiograms PeerJ 2020附件中还提供了好几份数据集合代码，非常好的学习素材。我在看这个包的帮助文档的时候也发现了展示2个或者3个基因组共线性分析的图。需要准备的数据是两个数据框，第一个是基因组的基本信息，包括第二个是共线性分析的结果了解了基本的数据输入格式，那么我们就可以将blast的比对结果转化成这种形式。首先是使用blast比对 构建数据库比对构造RIdeogram的输入数据df1.txt文件内容output6.txt文件内容作图代码结果但是这个图有一个缺点是不能体现出两条序列长度的差异，不知道能不能按长度的比列来显示，如何用代码实现暂时还不知道。 想到一个办法是出图后手动加上刻度线。关于怎么使用R语言包RIdeogram展示blast双序列比对结果问题的解答就分享到这里了，希望以上内容可以对大家有一定的帮助，如果你还有很多疑惑没有解开，可以关注开发云行业资讯频道了解更多相关知识。
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